Koi к Senkyo к Шоколаду следует за главным героем Уджимой Юуки, который посещает Частную Академию Takafuji, большую школу с более чем 6 000 студентов. Yuuki - элемент клуба исследования еды, наряду с семью другими, включая его друга детства Сумииоши Чисато. Элементы спокойно проводят свое время в клубе, не участвующем во многих действиях. Когда выборы следующего студенческого муниципального президента подходят, лидер, Шиноноум Сацуки, предлагает, чтобы клубы без заслуги были разделены и впоследствии отменены. Клуб исследования еды, в действии отчаяния, обращается за советом от муниципального президента нынешнего студента, Мори Йякумо, который предлагает финиширование Yuuki выборов в качестве кандидата противоположной команды. Yuuki узнает о проблемах, бывших обращенным к школе, и решает к финишированию выборов.