Начало — В городе Митэкихара, Кэнэйме Мэдоке, наряду с ее подругой, Мики Саякой, сталкивается с существом по имени Кюуби и спасено от ведьм волшебной девочкой Томо Мами. Kyuubee предлагает Мэдоке и Саяке шанс иметь любое желание, исполненное в обмен на становление волшебной девочкой и борьбу с ведьмами, пока Акеми Хомура, другая волшебная девочка и недавний студент передачи, сильно против Мэдоки, становящегося один. Прежде чем Мэдока может принять решение, однако, Мами убита ведьмой, оставив Мэдоку слишком боящимся, чтобы стать волшебной девочкой. Саяка, однако, решает стать самой волшебной девочкой, чтобы излечить руку ее друга детства, Камиджоу Кюсьюка. Поскольку Саяка скоро вступает в конфликт с другой волшебной девочкой по имени Сакура Кеуко, они, наряду с Мэдокой, изучают шокирующую правду, что их Драгоценные камни Души, источник их волшебных полномочий, буквально содержат их души.
Вечный — Мэдока извлекает уроки из Kyuubee, реальная идентичность которого - Инкубатор, что его разновидность делает контракты, чтобы превратить девочек в волшебных девочек, которые неизбежно становятся ведьмами, чтобы использовать энергию, которая мечет икру от их отчаяния, чтобы противостоять энтропии во вселенной. Кеуко, надеющийся на шанс, что Саяка может быть сделана человеческой снова, берет Мэдоку с нею, чтобы попытаться достигнуть ее человечества. Это в конечном счете терпит неудачу с Кеуко, принимающим решение пожертвовать собой, чтобы уничтожить Саяку с нею. Между тем это показано, что Хомура происходит из другого графика времени, вновь переживая тот же самый месяц несколько раз в надежде на спасение Мэдоки от мрачной судьбы в руках окончательной ведьмы, Уолперджиснэчт. Хомура пытается столкнуться с Уолперджиснэчт, но в конечном счете побежден и тянет близко к отчаянию, чувствуя, что ее усилия становятся бессмысленным. Именно тогда Мэдока появляется и использует созданную энергию от нескольких графиков времени, чтобы стать влиятельной волшебной девочкой, способной к устранению ведьм, прежде чем они родятся.
Восстание — Мэдока раньше было нормальной девочкой, живущей счастливо. Это все закончилось, когда она пожертвовала собой, чтобы спасти других волшебных девочек от совершенно жестокой судьбы, которая ждала их. Неспособный позволить ее воспоминаниям о Мэдоке умереть, Homura продолжает бороться один в мире, который Мэдока оставил позади для человечества, чтобы видеть ее улыбку еще раз.
Источник: ANN
Примечание: первые два фильма - компиляция телесериала, и третий фильм - совершенно новая история. Уробачи Ген сказал, что история третьего фильма по совпадению соответствует лирике к телевизионной заканчивающейся музыкальной теме Калафиной Magia, если Вы исследуете их тщательно.